Protein–RNA interactions for Protein: P84243

H3F3A, Histone H3.3, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3AP84243 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
H3F3AP84243 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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H3F3AP84243 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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H3F3AP84243 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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H3F3AP84243 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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H3F3AP84243 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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H3F3AP84243 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
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H3F3AP84243 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
H3F3AP84243 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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