Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 WDR3-202ENST00000369441 1035 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCA4P51532 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms