Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
FNTBP49356 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
FNTBP49356 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTBP49356 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTBP49356 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTBP49356 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTBP49356 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
FNTBP49356 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms