Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
DMDP11532 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DMDP11532 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DMDP11532 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DMDP11532 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DMDP11532 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DMDP11532 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DMDP11532 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DMDP11532 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms