Protein–RNA interactions for Protein: P10589

NR2F1, COUP transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2F1P10589 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
NR2F1P10589 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms