Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KDM5DQ9BY66 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms