Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cln3Q61124 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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Cln3Q61124 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cln3Q61124 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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