Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBL2

ZNF628, Zinc finger protein 628, humanhuman

Predictions only

Length 1,059 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF628Q5EBL2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ZNF628Q5EBL2 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms