Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
MSMPQ1L6U9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms