Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ITSN1Q15811 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms