Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SKIV2LQ15477 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms