Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FOXF1Q12946 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
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FOXF1Q12946 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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FOXF1Q12946 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
FOXF1Q12946 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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