Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 PHF14-201ENST00000403050 4276 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ERFP50548 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
ERFP50548 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms