Protein–RNA interactions for Protein: P35968

KDR, Vascular endothelial growth factor receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDRP35968 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDRP35968 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDRP35968 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
KDRP35968 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
KDRP35968 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
KDRP35968 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
KDRP35968 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms