Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 TPGS2-209ENST00000589049 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
PSDA5PKW4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms