Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms