Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CTSFQ9UBX1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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