Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2AFJQ9BTM1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms