Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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USP53Q70EK8 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
USP53Q70EK8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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