Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 GTF2A2-204ENST00000396063 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCDC85BQ15834 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
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