Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CHRNA6Q15825 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
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