Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SKIV2LQ15477 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms