Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
GRIN2CQ14957 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
GRIN2CQ14957 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms