Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SCARF1Q14162 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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