Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
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