Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CACNB2Q08289 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms