Protein–RNA interactions for Protein: Q05D32

CTDSPL2, CTD small phosphatase-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSPL2Q05D32 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CTDSPL2Q05D32 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57 ms