Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BNC1Q01954 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms