Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SALL3Q9BXA9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.74
SALL3Q9BXA9 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms