Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
LTV1Q96GA3 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms