Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC024361.2-201ENST00000574471 898 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AP003392.6-201ENST00000607709 325 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
STRCQ7RTU9 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
STRCQ7RTU9 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms