Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUD6

FAM69B, Protein FAM69B, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM69BQ5VUD6 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
FAM69BQ5VUD6 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms