Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC93Q567U6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC93Q567U6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms