Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZIC1Q15915 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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ZIC1Q15915 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ZIC1Q15915 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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