Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CNGB1Q14028 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CNGB1Q14028 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms