Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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SRSF6Q13247 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
SRSF6Q13247 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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