Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
CHD3Q12873 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
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CHD3Q12873 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHD3Q12873 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHD3Q12873 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHD3Q12873 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHD3Q12873 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
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CHD3Q12873 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
CHD3Q12873 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
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