Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRF9Q00978 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms