Protein–RNA interactions for Protein: P41439

FOLR3, Folate receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOLR3P41439 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
FOLR3P41439 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms