Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
VPREB1P12018 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms