Protein–RNA interactions for Protein: P01040

CSTA, Cystatin-A, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTAP01040 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTAP01040 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTAP01040 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTAP01040 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTAP01040 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTAP01040 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTAP01040 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTAP01040 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CSTAP01040 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTAP01040 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTAP01040 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTAP01040 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTAP01040 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CSTAP01040 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CSTAP01040 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CSTAP01040 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CSTAP01040 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms