Protein–RNA interactions for Protein: O75145

PPFIA3, Liprin-alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA3O75145 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PPFIA3O75145 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms