Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAB9BQ9NP90 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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RAB9BQ9NP90 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
RAB9BQ9NP90 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RAB9BQ9NP90 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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