Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SMPDL3AQ92484 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMPDL3AQ92484 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms