Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RNF148Q8N7C7 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms