Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CLDN19Q8N6F1 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CLDN19Q8N6F1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CLDN19Q8N6F1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CLDN19Q8N6F1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CLDN19Q8N6F1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CLDN19Q8N6F1 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
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CLDN19Q8N6F1 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms