Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TAF1AQ15573 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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