Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HDAC1Q13547 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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