Protein–RNA interactions for Protein: Q12952

FOXL1, Forkhead box protein L1, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXL1Q12952 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
FOXL1Q12952 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms