Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

Predictions only

Length 1,337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PTPRJQ12913 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PTPRJQ12913 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 337.8 ms